Лабораторное исследование

Определение мутаций в 8, 11, 17 экзонах гена с-KIT методом ПЦР и секвенирования (кровь)

Лабораторное исследование для определения генетической мутации гена cKIT. Наличие мутации гена ассоциировано с развитием гастроинтестинальных стромальных опухолей, острого миелоидного лейкоза, меланомы и ряда других опухолей различной локализации.

03.05.2024 1 мин мин чтения

Определение мутаций в 8, 11, 17 экзонах гена с-KIT методом ПЦР и секвенирования (кровь)

Лабораторное исследование для определения генетической мутации гена cKIT. Наличие мутации гена ассоциировано с развитием гастроинтестинальных стромальных опухолей, острого миелоидного лейкоза, меланомы и ряда других опухолей различной локализации.

Зачем сдавать этот анализ?

- подбор препарата для таргетной терапии гастроинтестинальной стромальной опухоли, меланомы и ряда других опухолей

- прогноз рецидивов заболевания

Подробное описание исследования

Ген KIT находится на длинном плече 4-й хромосомы (4q11–4q13), в его состав входит 21 экзон. Продуктом экспрессии гена является CD117 - рецепторный белок тирозинкиназы.

CD117(кластер дифференцировки 117, рецептор фактора роста тучных и стволовых клеток (SCFR), протоонкоген c-kit, kit-протеин) - трансмембранный гликопротеид, принадлежащий к III типу рецепторных тирозинкиназ.

Рецептор синтезируется на поверхности гемопоэтических стволовых клеток, полипотентных клеток и промиелобластов. Обнаруживается в интерстициальных клетках Кахаля в стенке органов ЖКТ, клетках потовых желез, на поверхности тучных клеток и меланоцитов. Рецептор с-KIT включает в себя внеклеточный иммуноглобулиноподобный домен, трансмембранный, подмембранный и внутриклеточный домены. Сигнальные пути, которые он активирует, контролируют рост, деление (пролиферацию), выживаемость и миграцию клеток.

Тирозинкиназа c-KIT – клеточный гомолог вирусного онкогена vKit, который связывают с развитием саркомы у кошек.

 В структуре гена KIT выделяют четыре важнейших экзона, мутации в которых чаще всего приводят к развитию опухолей. Это экзоны 9, 11, 13 и 17. Активирующие мутации в гене KIT играют роль в развитии гастроинтестинальных стромальнаых опухолей, острого миелоидного лейкоза, меланомы, семиномы, мастоцитоза. Инактивирующие мутации связывают с аозникновением генетического заболевания пибальдизм.

Большинство гастроинтестинальных опухолей несет активирующие мутации в гене с-KIT (до 85% случаев), которые классифицируются на делеции (утрата нуклеотида), дупликации (повтор), инсерции (вставка другой последовательности ДНК) и точечные мутации. Насчитывают более 300 типов активирующих мутаций с-KIT. Чаще всего мутации происходят в 11 и 9 экзонах (участках), реже в 13 и 17 экзонах. 

В подавляющем большинстве случаев происходят делеции или замены 550–560 кодонов 11 экзона. Делеции 557-558 кодонов 11 экзона гена c-KIT регистрируются в 28% случаев гастроинтестинальной стромальной опухоли. Исследования показали, что такие мутации связаны с повышенным риском метастазирования, рецидивов и указывают на плохой прогноз. Почти все гастроинтестинальные стромальные опухоли, несущие делецию 11 экзона гена с-KIT входят в группу высокого риска прогрессирования заболевания или имеют явную злокачественность, что указывает на более агрессивное клиническое проявление опухолей с такой делецией.

Дупликации в 11 экзоне чаще всего диагностируют у женщин с желудочной локализацией гастроинтестинальной стромальной опухоли и связаны с благоприятным прогнозом.

Мутации в 9 экзоне встречаются примерно в 15% случаев гастроинтестинальной стромальной опухоли и характерны для опухолей тонкой кишки.

При назначении таргетной терапии при метастатической ГИСО важно учитывать чувствительность мутаций к KIT-ингибитором. Наиболее выраженный ответ на терапию отмечен при наличии мутаций в 11 экзоне, меньший - при мутациях в 9 экзоне и отсутствие ответа при мутациях в 13 и 17 экзонах гена KIT.

В 10-15% случаев меланомы обнаружены мутации в гене c-Kit. Высокая чувствительность меланомы к терапии KIT-ингибиторами отмечается при  мутациях в 11 и 13 экзонах (W557, V559, L576P, K642E), минимальный ответ или отсутствие чувствительности наблюдается при мутации в 17 экзоне.  

Сегодня мутации с-KIT являются необходимым клиническим маркером, позволяющим предсказать и оценить эффективность терапии ряда опухолей.

Для индивидуализации терапии больных также необходимы полный клинический анамнез, точное гистологическое исследование опухолевого образца и его молекулярно-генетический анализ для определения активированных онкогенов. 

Источники

  1. Клинические рекомендации «Гастроинтестинальные стромальные опухоли», утв. Министерством здравоохранения Российской Федерации, 2018 г.
  2. Гвалдин Д.Ю. Современные представления о молекулярных механизмах в онкогенезе гастроинтестинальных стромальных опухолей. // Гвалдин Д.Ю., Омельчук Е.П., Тимошкина Н.Н., Трифанов В.С., Сидоренко Ю.С. – Вопросы онкологии, 2020 г. №1. С.13-22.
  3. H.Wong, A.Boussouar, L.Mazelin, S.Tauszig-Delamasure, Y.Sun, D.Goldschneider, A.Paradisi, P.Mehlen. The Proto-oncogene c-Kit inhibits tumor growth by behaving as a dependence receptor. – Molecular cell, 2018. Nov 1;72(3):413-425.e5. Doi: 10.1016/j.molcel.2018.08.040. 

Подготовка к исследованию

1. Кровь сдают утром натощак – после последнего приема пищи должно пройти как минимум 8 часов. Вечером накануне поужинайте легкой нежирной пищей.

2. За 2 часа до сдачи крови на анализ нельзя курить, пить кофе и чай, а также фруктовые соки. Допустимо употребление небольшого количества негазированной воды – не сладкой, не соленой, не минеральной.

3. В течение 24 часов до анализа крови нельзя употреблять алкоголь. Также, по согласованию с лечащим врачом, необходимо отменить прием лекарственных препаратов.

4. За час до исследования избегайте психоэмоционального напряжения, физического напряжения, такого как быстрый подъем по лестнице, бег. Желательно прийти в отделение лаборатории заблаговременно и в течение 10-15 минут до сдачи крови спокойно посидеть.

5. Не сдавайте кровь сразу после физиотерапевтических процедур, массажа и инструментальных обследований, таких как УЗИ и рентген, в течение 5-7 дней.

6. Если вы контролируете лабораторные показатели в динамике, постарайтесь сдавать каждый анализ в одно и то же время при одинаковых условиях.

Противопоказания и ограничения

Абсолютных противопоказаний нет.

Интерпретация результата

Интерпретацию результатов исследования проводит специалист-генетик в комплексе с результатами других исследований.

Референсные значения

При исследовании полученного образца ДНК не выявлено активирующих мутаций гена с-KIT.

Общий анализ крови в норме

ПоказательЗначение в норме
Общие показатели крови
ГемоглобинМужчины: 130,0–160,0 г/л
Женщины: 120,0–140,0 г/л
Количество эритроцитовМужчины: 4,0–5,5 × 1012
Женщины: 3,7–4,7 × 1012
ГематокритМужчины: 41–53%
Женщины: 36–46%
Цветовой показатель0,86–1,1
Количество ретикулоцитов0,7% (от 0,2% до 1,2%)
Количество лейкоцитов4–9 × 109
Количество тромбоцитов180–320 × 109
Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)Мужчины: 1–10 мм/час
Женщины: 2–15 мм/час

Биохимические показатели крови

ПоказательЗначение в норме
Белки и аминокислоты
Общий белок65,0–85,0 г/л
Альбумин35–55 г/л
ГомоцистеинМужчины: 6,26–15,01 мкмоль/л
Женщины: 4,6–12,44 мкмоль/л
МиоглобинМужчины: 19–92 мкг/л
Женщины: 12–76 мкг/л
ОстеокальцинМужчины: 12,0–52,1 нг/мл
Женщины: 5,4–59,1 нг/мл
ФерритинМужчины: 20–250 мкг/л
Женщины: 10–120 мкг/л
Ферменты крови
Аланинаминотрансфераза (АЛТ)Мужчины: 18,0 Ед/л
Женщины: 15,0 Ед/л
Аспартатаминотрансфераза (АСТ)Мужчины: 22,0 Ед/л
Женщины: 17,0 Ед/л
Гамма-глутамилтрансферазаМужчины: 32 Ед/л
Женщины: 49 Ед/л
Амилаза (α-амилаза)3,3–8,9 мг/(с х л)
Амилаза панкреатическаядо 50 Ед/л
Лактатдегидрогеназа120–240 Ед/л
КреатинфосфокиназаМужчины: 190 Ед/л
Женщины: 167 Ед/л
Фосфатаза щелочнаяМужчины: до 270 Ед/л
Женщины: до 240 Ед/л
Липазаот 0 до 190 Ед/мл
Холинэстераза5300–12900 Ед/л
С-пептид0,7–4,0 нг/л
Липиды крови
Общий холестерин3,6–5,2 ммоль/л
Холестерин ЛПНПменее 3,5 ммоль/л
Холестерин ЛПВП0,9–1,9 ммоль/л
Триглицеридыменее 1,7 ммоль/л
Углеводы крови
Глюкоза крови3,89–5,83 ммоль/л
Фруктозамин15–285 мкмоль/л
Пигменты
Прямой (связанный) билирубиндо 3,4 мкмоль/л
Непрямой (свободный) билирубиндо 19 мкмоль/л
Низкомолекулярные азотистые вещества
КреатининМужчины: 80–115 мкмоль/л
Женщины: 53–97 мкмоль/л
Мочевая кислотаМужчины: 262–452 мкмоль/л
Женщины: 137–393 мкмоль/л
Мочевина2,1–7,1 ммоль/л
Остаточный азот14,3–28,6 ммоль/л
Неорганические вещества и витамины
Витамин B12208–963,5 пг/мл
Витамин D30–100 нг/мл
ЖелезоМужчины: 10,7–30,4 мкмоль/л
Женщины: 9–23,3 мкмоль/л
Калий3,5–5,1 ммоль/л
Кальций1,17–1,29 ммоль/л
Натрий136–145 ммоль/л
Хлор98–107 ммоль/л
Магний0,66–1,07 ммоль/л
Фосфор0,87–1,45 ммоль/л
Фолиевая кислота7,2–15,4 нг/мл
Evidence-based

Профессиональная база знаний

Актуальные версии МКБ, клинические рекомендации и протоколы лечения

🧲 Акция месяца

Пройдите МРТ со скидкой 20%

Современное оборудование, опытные врачи и результат уже через 30 минут. Запишитесь на исследование в Тюмени.

Безопасно
Опытные врачи
Результат от 30 мин