Молекулярно-генетическое исследование мутаций 15 экзона гена BRAF (биопсийный/операционный материал)
Лабораторное исследование для определения генетических мутаций 15 экзона гена BRAF. Наличие мутации провоцирует развитие меланомы, папиллярной карциномы, колоректального рака, рака яичников и ряда других опухолей различной локализации.
Зачем сдавать этот анализ?
- Определения показаний к назначению таргетной терапии.
- Меланома.
- Папиллярная карцинома.
- Немелкоклеточный рак легкого.
- Колоректальный рак.
- Рак яичников.
Подробное описание исследования
В последнее время уделяется большое внимание различным молекулярным маркерам, характеризующим биологические свойства опухоли. Молекулярно-генетические исследования выявляют тесную связь злокачественной̆ прогрессии опухолей̆ с накоплением соматических мутаций.
На формирование этих мутаций могут оказывать влияние, как эндогенные (свободные радикалы), так и экзогенные факторы (факторы внешней среды). Итогом такого влияния могут стать генетические нарушения в системе восстановления ДНК.
Ген BRAF расположен на длинном плече 7-й хромосомы в позиции 34 (7q34). Продукт гена — белок BRAF или серин-треонин-киназа- является важным звеном сигнального пути (RAS-BRAF-MAPK) и играет ключевую роль в процессах дифференциации клеток, их роста и клеточной гибели. Среди трех изоформ RAF-киназы (ARAF, BRAF, CRAF) BRAF имеет наибольшую активность и чувствительность. Чаще всего генетические изменения происходят в 15-м экзоне гена BRAF на участке V600E (T1799A), значительно реже встречаются мутации V600K, V600D и V600R.
Миссенс-мутация (точечная мутация) V600E приводит к замещению валина на глутамин в 600-м кодоне 15 экзона. При мутации V600K происходит замена валина на лизин, при V600D — на аспарагиновую кислоту, V600R — на аргинин. Мутации в 15 экзоне характеризуются как активирующие — усиливающие активность продукта гена. Мутации в гене BRAF активируют неконтролируемый рост (пролиферацию) опухолевых клеток, что приводит к увеличению опухоли в размерах и быстрому метастазированию.
Мутации в гене BRAF встречаютсяпри меланоме, немелкоклеточном раке легких, метастатическом колоректальном раке, трижды негативном раке молочной железы, папиллярном раке щитовидной железы и др.
Мутации гена BRAF характеризует более агрессивное течение заболевания и определяются в 8 % случаев опухолей.
Наиболее часто диагностируют при меланоме (60–70 %) и папиллярной карциноме (39— 83 %), при колоректальном раке (10–14 %), раке яичников, реже — в мелкоклеточном раке легкого.
Определить генетическую мутацию BRAF можно, используя молекулярно-генетические методы исследования. Материалом для исследования служит ДНК, полученная из биоптатов опухолевой ткани, а также из образцов тканей метастатического очага.
Базовый метод, позволяющий выявить мутации гена BRAF — полимеразная цепная реакция (ПЦР). Этот метод диагностики прост в использовании и обладает хорошей чувствительностью, но за один раз позволяет определить только одну мутацию, а их часто бывает несколько и все они имеют диагностическое значение.
Поэтому приходится выполнять еще один забор тканей, что не всегда представляется возможным. Метод, позволяющий в одном образце ткани выявить все мутации гена BRAF — секвенирование.
Ген BRAF — важный маркер для оценки природы опухоли. В основном определяется в предоперационной диагностике, а также при выборе препарата для дальнейшей химиотерапии.
Потому как, например, меланома (при которой часто определяется данная мутация) обладает высоким процентом устойчивости к традиционным схемам химиотерапии.
И терапия меланомы на современном этапе представляет собой комплекс мероприятий, направленных на блокаду основных сигнальных путей, специфичных для меланомы кожи, при помощи препаратов блокирующих продукты онкогенов.
В случае назначения подобных таргетных препаратов, определение статуса гена BRAF — обязательное исследование, потому как при отсутствии мутации затратное лечение окажется неэффективным, а в некоторых случаях может ускорить опухолевый процесс.
Источники
- Клинические рекомендации, утв. Министерством здравоохранения Российской Федерации «Меланома кожи и слизистых оболочек», 2019 г.
- Абрамова О.Э. Мутация гена BRAF V600 в опухолевых клетках — фактор неблагоприятного течения меланомы кожи? // Абрамова О.Э., Кудрявцев Д.В., Шинкаркина А.П., Гуменецкая Ю.В., Кудрявцева Г.Т., Конова М.В. — Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи, 2019 г. № 2. С.12-17.
- M.Dankner, A.N.Rose, S.Rajkumar, P.M.Siegel, I.R.Watson. Classifying BRAF alterations in cancer: new rational therapeutic strategies for actionable mutations. — Oncogene, 2018. Jun;37(24):3183-3199. Doi: 10.1038/s41388-018-0171-x.
- NCBI : Gene ID: 673 «BRAF B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase »
- Dienstmann R. and Tabernero J. «BRAF as a Target for Cancer Therapy», Anti-Cancer Agents in Medicinal Chemistry, 2011, 11, 285-295 BRAF gene
- Tiacci E., Trifonov V. et al. (June 2011). «*BRAF *mutations in hairy-cell leukemia». N. Engl. J. Med. 364(24): 2305–2315 BRAF gene: From human cancers to developmental syndromes
Подготовка к исследованию
Специальной подготовки не требуется.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Интерпретация результата
Интерпретацию результатов исследования проводит специалист-генетик в комплексе с результатами других исследований.
Референсные значения
Мутация не обнаружена
Общий анализ крови в норме
| Показатель | Значение в норме |
|---|---|
| Общие показатели крови | |
| Гемоглобин | Мужчины: 130,0–160,0 г/л Женщины: 120,0–140,0 г/л |
| Количество эритроцитов | Мужчины: 4,0–5,5 × 1012/л Женщины: 3,7–4,7 × 1012/л |
| Гематокрит | Мужчины: 41–53% Женщины: 36–46% |
| Цветовой показатель | 0,86–1,1 |
| Количество ретикулоцитов | 0,7% (от 0,2% до 1,2%) |
| Количество лейкоцитов | 4–9 × 109/л |
| Количество тромбоцитов | 180–320 × 109/л |
| Скорость оседания эритроцитов (СОЭ) | Мужчины: 1–10 мм/час Женщины: 2–15 мм/час |
Биохимические показатели крови
| Показатель | Значение в норме |
|---|---|
| Белки и аминокислоты | |
| Общий белок | 65,0–85,0 г/л |
| Альбумин | 35–55 г/л |
| Гомоцистеин | Мужчины: 6,26–15,01 мкмоль/л Женщины: 4,6–12,44 мкмоль/л |
| Миоглобин | Мужчины: 19–92 мкг/л Женщины: 12–76 мкг/л |
| Остеокальцин | Мужчины: 12,0–52,1 нг/мл Женщины: 5,4–59,1 нг/мл |
| Ферритин | Мужчины: 20–250 мкг/л Женщины: 10–120 мкг/л |
| Ферменты крови | |
| Аланинаминотрансфераза (АЛТ) | Мужчины: 18,0 Ед/л Женщины: 15,0 Ед/л |
| Аспартатаминотрансфераза (АСТ) | Мужчины: 22,0 Ед/л Женщины: 17,0 Ед/л |
| Гамма-глутамилтрансфераза | Мужчины: 32 Ед/л Женщины: 49 Ед/л |
| Амилаза (α-амилаза) | 3,3–8,9 мг/(с х л) |
| Амилаза панкреатическая | до 50 Ед/л |
| Лактатдегидрогеназа | 120–240 Ед/л |
| Креатинфосфокиназа | Мужчины: 190 Ед/л Женщины: 167 Ед/л |
| Фосфатаза щелочная | Мужчины: до 270 Ед/л Женщины: до 240 Ед/л |
| Липаза | от 0 до 190 Ед/мл |
| Холинэстераза | 5300–12900 Ед/л |
| С-пептид | 0,7–4,0 нг/л |
| Липиды крови | |
| Общий холестерин | 3,6–5,2 ммоль/л |
| Холестерин ЛПНП | менее 3,5 ммоль/л |
| Холестерин ЛПВП | 0,9–1,9 ммоль/л |
| Триглицериды | менее 1,7 ммоль/л |
| Углеводы крови | |
| Глюкоза крови | 3,89–5,83 ммоль/л |
| Фруктозамин | 15–285 мкмоль/л |
| Пигменты | |
| Прямой (связанный) билирубин | до 3,4 мкмоль/л |
| Непрямой (свободный) билирубин | до 19 мкмоль/л |
| Низкомолекулярные азотистые вещества | |
| Креатинин | Мужчины: 80–115 мкмоль/л Женщины: 53–97 мкмоль/л |
| Мочевая кислота | Мужчины: 262–452 мкмоль/л Женщины: 137–393 мкмоль/л |
| Мочевина | 2,1–7,1 ммоль/л |
| Остаточный азот | 14,3–28,6 ммоль/л |
| Неорганические вещества и витамины | |
| Витамин B12 | 208–963,5 пг/мл |
| Витамин D | 30–100 нг/мл |
| Железо | Мужчины: 10,7–30,4 мкмоль/л Женщины: 9–23,3 мкмоль/л |
| Калий | 3,5–5,1 ммоль/л |
| Кальций | 1,17–1,29 ммоль/л |
| Натрий | 136–145 ммоль/л |
| Хлор | 98–107 ммоль/л |
| Магний | 0,66–1,07 ммоль/л |
| Фосфор | 0,87–1,45 ммоль/л |
| Фолиевая кислота | 7,2–15,4 нг/мл |
Профессиональная база знаний
Актуальные версии МКБ, клинические рекомендации и протоколы лечения
Status Localis
Локальный статус: описание и шаблоны
ПерейтиМКБ-10
Международная классификация болезней 10-го пересмотра
ПерейтиМКБ-11
Актуальная версия классификации болезней
ПерейтиМКФ
Международная классификация функционирования
ПерейтиРецепты на латыни
Rp.: Scripts. База лекарственных препаратов
ПерейтиКлинические рекомендации
Стандарты оказания помощи
ПерейтиСредства реабилитации
ТСР, ортезы, протезы, ИПРА
ПерейтиСроки нетрудоспособности
Ориентировочные сроки ВН
ПерейтиКоды операций
Номенклатура медицинских услуг
ПерейтиОценочные шкалы
Классификации и индексы
ПерейтиНормы анализов
Референсные значения
ПерейтиМКБ-О
Классификация опухолей
ПерейтиЗОЖ
Профилактика и здоровый образ жизни
Перейти