Определение мутаций в 8, 11, 17 экзонах гена с-KIT методом ПЦР и секвенирования (кровь)
Лабораторное исследование для определения генетической мутации гена cKIT. Наличие мутации гена ассоциировано с развитием гастроинтестинальных стромальных опухолей, острого миелоидного лейкоза, меланомы и ряда других опухолей различной локализации.
Зачем сдавать этот анализ?
- подбор препарата для таргетной терапии гастроинтестинальной стромальной опухоли, меланомы и ряда других опухолей
- прогноз рецидивов заболевания
Подробное описание исследования
Ген KIT находится на длинном плече 4-й хромосомы (4q11–4q13), в его состав входит 21 экзон. Продуктом экспрессии гена является CD117 - рецепторный белок тирозинкиназы.
CD117(кластер дифференцировки 117, рецептор фактора роста тучных и стволовых клеток (SCFR), протоонкоген c-kit, kit-протеин) - трансмембранный гликопротеид, принадлежащий к III типу рецепторных тирозинкиназ.
Рецептор синтезируется на поверхности гемопоэтических стволовых клеток, полипотентных клеток и промиелобластов. Обнаруживается в интерстициальных клетках Кахаля в стенке органов ЖКТ, клетках потовых желез, на поверхности тучных клеток и меланоцитов. Рецептор с-KIT включает в себя внеклеточный иммуноглобулиноподобный домен, трансмембранный, подмембранный и внутриклеточный домены. Сигнальные пути, которые он активирует, контролируют рост, деление (пролиферацию), выживаемость и миграцию клеток.
Тирозинкиназа c-KIT – клеточный гомолог вирусного онкогена vKit, который связывают с развитием саркомы у кошек.
В структуре гена KIT выделяют четыре важнейших экзона, мутации в которых чаще всего приводят к развитию опухолей. Это экзоны 9, 11, 13 и 17. Активирующие мутации в гене KIT играют роль в развитии гастроинтестинальных стромальнаых опухолей, острого миелоидного лейкоза, меланомы, семиномы, мастоцитоза. Инактивирующие мутации связывают с аозникновением генетического заболевания пибальдизм.
Большинство гастроинтестинальных опухолей несет активирующие мутации в гене с-KIT (до 85% случаев), которые классифицируются на делеции (утрата нуклеотида), дупликации (повтор), инсерции (вставка другой последовательности ДНК) и точечные мутации. Насчитывают более 300 типов активирующих мутаций с-KIT. Чаще всего мутации происходят в 11 и 9 экзонах (участках), реже в 13 и 17 экзонах.
В подавляющем большинстве случаев происходят делеции или замены 550–560 кодонов 11 экзона. Делеции 557-558 кодонов 11 экзона гена c-KIT регистрируются в 28% случаев гастроинтестинальной стромальной опухоли. Исследования показали, что такие мутации связаны с повышенным риском метастазирования, рецидивов и указывают на плохой прогноз. Почти все гастроинтестинальные стромальные опухоли, несущие делецию 11 экзона гена с-KIT входят в группу высокого риска прогрессирования заболевания или имеют явную злокачественность, что указывает на более агрессивное клиническое проявление опухолей с такой делецией.
Дупликации в 11 экзоне чаще всего диагностируют у женщин с желудочной локализацией гастроинтестинальной стромальной опухоли и связаны с благоприятным прогнозом.
Мутации в 9 экзоне встречаются примерно в 15% случаев гастроинтестинальной стромальной опухоли и характерны для опухолей тонкой кишки.
При назначении таргетной терапии при метастатической ГИСО важно учитывать чувствительность мутаций к KIT-ингибитором. Наиболее выраженный ответ на терапию отмечен при наличии мутаций в 11 экзоне, меньший - при мутациях в 9 экзоне и отсутствие ответа при мутациях в 13 и 17 экзонах гена KIT.
В 10-15% случаев меланомы обнаружены мутации в гене c-Kit. Высокая чувствительность меланомы к терапии KIT-ингибиторами отмечается при мутациях в 11 и 13 экзонах (W557, V559, L576P, K642E), минимальный ответ или отсутствие чувствительности наблюдается при мутации в 17 экзоне.
Сегодня мутации с-KIT являются необходимым клиническим маркером, позволяющим предсказать и оценить эффективность терапии ряда опухолей.
Для индивидуализации терапии больных также необходимы полный клинический анамнез, точное гистологическое исследование опухолевого образца и его молекулярно-генетический анализ для определения активированных онкогенов.
Источники
- Клинические рекомендации «Гастроинтестинальные стромальные опухоли», утв. Министерством здравоохранения Российской Федерации, 2018 г.
- Гвалдин Д.Ю. Современные представления о молекулярных механизмах в онкогенезе гастроинтестинальных стромальных опухолей. // Гвалдин Д.Ю., Омельчук Е.П., Тимошкина Н.Н., Трифанов В.С., Сидоренко Ю.С. – Вопросы онкологии, 2020 г. №1. С.13-22.
- H.Wong, A.Boussouar, L.Mazelin, S.Tauszig-Delamasure, Y.Sun, D.Goldschneider, A.Paradisi, P.Mehlen. The Proto-oncogene c-Kit inhibits tumor growth by behaving as a dependence receptor. – Molecular cell, 2018. Nov 1;72(3):413-425.e5. Doi: 10.1016/j.molcel.2018.08.040.
Подготовка к исследованию
1. Кровь сдают утром натощак – после последнего приема пищи должно пройти как минимум 8 часов. Вечером накануне поужинайте легкой нежирной пищей.
2. За 2 часа до сдачи крови на анализ нельзя курить, пить кофе и чай, а также фруктовые соки. Допустимо употребление небольшого количества негазированной воды – не сладкой, не соленой, не минеральной.
3. В течение 24 часов до анализа крови нельзя употреблять алкоголь. Также, по согласованию с лечащим врачом, необходимо отменить прием лекарственных препаратов.
4. За час до исследования избегайте психоэмоционального напряжения, физического напряжения, такого как быстрый подъем по лестнице, бег. Желательно прийти в отделение лаборатории заблаговременно и в течение 10-15 минут до сдачи крови спокойно посидеть.
5. Не сдавайте кровь сразу после физиотерапевтических процедур, массажа и инструментальных обследований, таких как УЗИ и рентген, в течение 5-7 дней.
6. Если вы контролируете лабораторные показатели в динамике, постарайтесь сдавать каждый анализ в одно и то же время при одинаковых условиях.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Интерпретация результата
Интерпретацию результатов исследования проводит специалист-генетик в комплексе с результатами других исследований.
Референсные значения
При исследовании полученного образца ДНК не выявлено активирующих мутаций гена с-KIT.
Общий анализ крови в норме
| Показатель | Значение в норме |
|---|---|
| Общие показатели крови | |
| Гемоглобин | Мужчины: 130,0–160,0 г/л Женщины: 120,0–140,0 г/л |
| Количество эритроцитов | Мужчины: 4,0–5,5 × 1012/л Женщины: 3,7–4,7 × 1012/л |
| Гематокрит | Мужчины: 41–53% Женщины: 36–46% |
| Цветовой показатель | 0,86–1,1 |
| Количество ретикулоцитов | 0,7% (от 0,2% до 1,2%) |
| Количество лейкоцитов | 4–9 × 109/л |
| Количество тромбоцитов | 180–320 × 109/л |
| Скорость оседания эритроцитов (СОЭ) | Мужчины: 1–10 мм/час Женщины: 2–15 мм/час |
Биохимические показатели крови
| Показатель | Значение в норме |
|---|---|
| Белки и аминокислоты | |
| Общий белок | 65,0–85,0 г/л |
| Альбумин | 35–55 г/л |
| Гомоцистеин | Мужчины: 6,26–15,01 мкмоль/л Женщины: 4,6–12,44 мкмоль/л |
| Миоглобин | Мужчины: 19–92 мкг/л Женщины: 12–76 мкг/л |
| Остеокальцин | Мужчины: 12,0–52,1 нг/мл Женщины: 5,4–59,1 нг/мл |
| Ферритин | Мужчины: 20–250 мкг/л Женщины: 10–120 мкг/л |
| Ферменты крови | |
| Аланинаминотрансфераза (АЛТ) | Мужчины: 18,0 Ед/л Женщины: 15,0 Ед/л |
| Аспартатаминотрансфераза (АСТ) | Мужчины: 22,0 Ед/л Женщины: 17,0 Ед/л |
| Гамма-глутамилтрансфераза | Мужчины: 32 Ед/л Женщины: 49 Ед/л |
| Амилаза (α-амилаза) | 3,3–8,9 мг/(с х л) |
| Амилаза панкреатическая | до 50 Ед/л |
| Лактатдегидрогеназа | 120–240 Ед/л |
| Креатинфосфокиназа | Мужчины: 190 Ед/л Женщины: 167 Ед/л |
| Фосфатаза щелочная | Мужчины: до 270 Ед/л Женщины: до 240 Ед/л |
| Липаза | от 0 до 190 Ед/мл |
| Холинэстераза | 5300–12900 Ед/л |
| С-пептид | 0,7–4,0 нг/л |
| Липиды крови | |
| Общий холестерин | 3,6–5,2 ммоль/л |
| Холестерин ЛПНП | менее 3,5 ммоль/л |
| Холестерин ЛПВП | 0,9–1,9 ммоль/л |
| Триглицериды | менее 1,7 ммоль/л |
| Углеводы крови | |
| Глюкоза крови | 3,89–5,83 ммоль/л |
| Фруктозамин | 15–285 мкмоль/л |
| Пигменты | |
| Прямой (связанный) билирубин | до 3,4 мкмоль/л |
| Непрямой (свободный) билирубин | до 19 мкмоль/л |
| Низкомолекулярные азотистые вещества | |
| Креатинин | Мужчины: 80–115 мкмоль/л Женщины: 53–97 мкмоль/л |
| Мочевая кислота | Мужчины: 262–452 мкмоль/л Женщины: 137–393 мкмоль/л |
| Мочевина | 2,1–7,1 ммоль/л |
| Остаточный азот | 14,3–28,6 ммоль/л |
| Неорганические вещества и витамины | |
| Витамин B12 | 208–963,5 пг/мл |
| Витамин D | 30–100 нг/мл |
| Железо | Мужчины: 10,7–30,4 мкмоль/л Женщины: 9–23,3 мкмоль/л |
| Калий | 3,5–5,1 ммоль/л |
| Кальций | 1,17–1,29 ммоль/л |
| Натрий | 136–145 ммоль/л |
| Хлор | 98–107 ммоль/л |
| Магний | 0,66–1,07 ммоль/л |
| Фосфор | 0,87–1,45 ммоль/л |
| Фолиевая кислота | 7,2–15,4 нг/мл |
Профессиональная база знаний
Актуальные версии МКБ, клинические рекомендации и протоколы лечения
Status Localis
Локальный статус: описание и шаблоны
ПерейтиМКБ-10
Международная классификация болезней 10-го пересмотра
ПерейтиМКБ-11
Актуальная версия классификации болезней
ПерейтиМКФ
Международная классификация функционирования
ПерейтиРецепты на латыни
Rp.: Scripts. База лекарственных препаратов
ПерейтиКлинические рекомендации
Стандарты оказания помощи
ПерейтиСредства реабилитации
ТСР, ортезы, протезы, ИПРА
ПерейтиСроки нетрудоспособности
Ориентировочные сроки ВН
ПерейтиКоды операций
Номенклатура медицинских услуг
ПерейтиОценочные шкалы
Классификации и индексы
ПерейтиНормы анализов
Референсные значения
ПерейтиМКБ-О
Классификация опухолей
ПерейтиЗОЖ
Профилактика и здоровый образ жизни
Перейти